1. เริ่มจากตั้งต่างที่ Tool > Preference..



2. ด้านซ้ายเลือกรายการ Multi-Instance ด้านขวาเลือก Always in multi-instance mode

    กด Close เมื่อตั้งค่าเรียบร้อย

3. ไปที่ไอคอนโปรแกรม Notepad++ คลิกขวาเลือก Properties

4. เพิ่มคำว่า  -multiInst  ต่อท้ายหลังเครื่องหมายฟันคู่  กด OK เพื่อเสร็จสิ้น


5. ดับเบิ้ลคลิกเพื่อเปิด Notepad++ เพื่อเปิดโปรแกรมขึ้นมา 2 หน้าต่าง



6. ด้านซ้ายเอาไว้เขียน JavaScript ก็ปรับธีมให้สีต่างกัน เพื่อจดจำง่ายเวลาสลับไปมา อีกอย่างคือปรับสไตล์ของโค้ดในแต่ละส่วนตามชอบได้ด้วยเมนู Settings > Style Configurator...


7. เลือก ธีม ที่ต้องการ ชอบโทนสว่าง โทนมืดก็มีให้เลือกหลายแบบ


8. หากเลือกธีมแล้ว ยังไม่ถูกใจกับสีของโค้ดในแต่ละส่วน ก็สามารถปรับเพิ่มเติมได้


9. ในหน้าต่างที่ 2 ก็ทำเช่นเดียวกัน แต่แนะนำให้เป็นคนละโทนสีกัน เพื่อความง่ายในการจดจำ

    JavaScript Window

    PHP Window




ที่มา
https://superuser.com/questions/549782/want-two-instances-windows-of-notepad